Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCARF2Q96GP6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms