Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms