Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HLA-CQ95604 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms