Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HGDQ93099 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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