Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRUQ92729 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms