Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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