Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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TMCO5AQ8N6Q1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCO5AQ8N6Q1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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