Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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C9orf40Q8IXQ3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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