Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP13Q86W25 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP13Q86W25 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms