Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms