Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC80Q76M96 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms