Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LRIG3Q6UXM1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms