Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HRCT1Q6UXD1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms