Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VSTM1Q6UX27 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms