Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms