Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms