Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAF7Q6Q0C0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF7Q6Q0C0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms