Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RWDD4Q6NW29 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms