Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms