Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225Q6GV28 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225Q6GV28 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms