Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLX4IPQ5VYV7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLX4IPQ5VYV7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms