Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GARNL3Q5VVW2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.5 ms