Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC7Q5VTL7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms