Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PRAMEF20Q5VT98 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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