Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C10orf55Q5SWW7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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