Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms