Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KHDC3LQ587J8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms