Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf17Q53FE4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms