Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KNOP1Q1ED39 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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