Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms