Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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