Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FXNQ16595 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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