Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP7Q16576 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms