Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYPL1Q16563 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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