Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DDB1Q16531 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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