Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GRIK4Q16099 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GRIK4Q16099 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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GRIK4Q16099 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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GRIK4Q16099 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK4Q16099 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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