Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP10Q15642 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms