Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms