Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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SYCP1Q15431 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SYCP1Q15431 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SYCP1Q15431 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYCP1Q15431 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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