Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDGFRLQ15198 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDGFRLQ15198 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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