Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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