Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD3Q15054 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD3Q15054 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms