Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHPRHQ149N8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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