Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK13Q14004 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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