Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF2H2Q13888 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GTF2H2Q13888 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GTF2H2Q13888 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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