Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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SHROOM2Q13796 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHROOM2Q13796 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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