Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SCGB2A2Q13296 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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SCGB2A2Q13296 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SCGB2A2Q13296 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SCGB2A2Q13296 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SCGB2A2Q13296 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SCGB2A2Q13296 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SCGB2A2Q13296 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SCGB2A2Q13296 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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