Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLN3Q13286 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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