Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR1H3Q13133 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms