Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLFQ13129 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLFQ13129 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLFQ13129 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RLFQ13129 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RLFQ13129 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RLFQ13129 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RLFQ13129 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RLFQ13129 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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